Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL16A1Q07092 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL16A1Q07092 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms