Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU5F1Q01860 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU5F1Q01860 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms