Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCBP4P57723 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCBP4P57723 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms