Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATN1P54259 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATN1P54259 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATN1P54259 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATN1P54259 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATN1P54259 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATN1P54259 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATN1P54259 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATN1P54259 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATN1P54259 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATN1P54259 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATN1P54259 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATN1P54259 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATN1P54259 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATN1P54259 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms