Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XBP1P17861 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XBP1P17861 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XBP1P17861 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XBP1P17861 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XBP1P17861 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XBP1P17861 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms