Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF888P0CJ79 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms