Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DOAP06340 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms