Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EGFRP00533 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms