Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF6O14896 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF6O14896 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF6O14896 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF6O14896 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms