Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms