Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms