Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC144AA2RUR9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC144AA2RUR9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms