Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms