Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms