Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
EHD3Q9NZN3 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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