Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms