Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CA9Q16790 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CA9Q16790 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms