Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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