Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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