Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
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