Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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NCOA4Q13772 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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NCOA4Q13772 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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NCOA4Q13772 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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NCOA4Q13772 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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NCOA4Q13772 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NCOA4Q13772 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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