Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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