| RUNX3 | Q13761 | SKP1P3-201 | ENST00000429280 | 487 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC241644.1-201 | ENST00000431525 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011891.1-201 | ENST00000437088 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P9-201 | ENST00000441799 | 583 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTMAP3-201 | ENST00000447474 | 330 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010891.1-201 | ENST00000449963 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NANOGP10-201 | ENST00000453325 | 895 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC009495.2-201 | ENST00000457108 | 506 nt | TSL 2 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LINC02146-201 | ENST00000504244 | 509 nt | TSL 3 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC010468.3-201 | ENST00000508225 | 458 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | NECAB1-205 | ENST00000522820 | 811 nt | TSL 2 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC100770.1-201 | ENST00000532310 | 322 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYRFL-202 | ENST00000535034 | 881 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000753.2-201 | ENST00000540307 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC005242.1-201 | ENST00000585658 | 438 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC092159.4-201 | ENST00000624944 | 550 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCN1A-220 | ENST00000641603 | 12506 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF573-217 | ENST00000590414 | 2225 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUPT3H-202 | ENST00000371459 | 2091 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF285B-201 | ENST00000561698 | 1767 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | QSER1-201 | ENST00000399302 | 9335 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRMP-201 | ENST00000354454 | 2504 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRL2-205 | ENST00000370717 | 5873 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KATNA1-202 | ENST00000335647 | 1684 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL592494.2-201 | ENST00000425455 | 1548 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP004289.2-201 | ENST00000444413 | 1457 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAB3-204 | ENST00000378932 | 3698 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10J1-203 | ENST00000642080 | 3503 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRL3-216 | ENST00000514157 | 4789 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01689-201 | ENST00000416218 | 2007 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NKTR-219 | ENST00000617821 | 7319 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD46.1-201 | ENST00000364139 | 104 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7-3-201 | ENST00000384898 | 110 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359643.1-201 | ENST00000404109 | 423 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL450992.3-201 | ENST00000413192 | 568 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138826.1-202 | ENST00000415106 | 692 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERMN-209 | ENST00000420719 | 1246 nt | TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL2BPP3-201 | ENST00000421226 | 480 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004448.2-201 | ENST00000422360 | 586 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093084.1-201 | ENST00000424233 | 687 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIGD1AP4-201 | ENST00000430194 | 280 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357507.1-201 | ENST00000435946 | 669 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02013-201 | ENST00000438156 | 526 nt | TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359378.1-201 | ENST00000439891 | 400 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390067.1-201 | ENST00000440009 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357052.1-201 | ENST00000443504 | 381 nt | TSL 3 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026320.1-202 | ENST00000444729 | 672 nt | TSL 3 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092902.1-201 | ENST00000486999 | 259 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL271P-201 | ENST00000487601 | 295 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-95P-201 | ENST00000516357 | 160 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-128P-201 | ENST00000516704 | 160 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01603-201 | ENST00000517343 | 1134 nt | TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008632.1-202 | ENST00000518605 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf22-204 | ENST00000522267 | 739 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022882.1-201 | ENST00000532142 | 501 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SOX5-AS1-201 | ENST00000539583 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121852.1-201 | ENST00000554665 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSMA3-213 | ENST00000557508 | 814 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC233266.2-201 | ENST00000567067 | 528 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005433.1-201 | ENST00000582939 | 620 nt | TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7515HG-243 | ENST00000591400 | 1067 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNX6P1-201 | ENST00000601728 | 1224 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011458.1-201 | ENST00000604034 | 617 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069200.1-201 | ENST00000609511 | 323 nt | BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356515.1-201 | ENST00000611081 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GXYLT1P5-202 | ENST00000618830 | 589 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BMPR1B-203 | ENST00000440890 | 5388 nt | TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NCOA1-201 | ENST00000288599 | 6952 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLAG1-201 | ENST00000316981 | 7322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HELLS-204 | ENST00000371332 | 2675 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC17A4-203 | ENST00000439485 | 3699 nt | TSL 5 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ECHDC1-222 | ENST00000531967 | 2585 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POSTN-201 | ENST00000379742 | 3071 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.06 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KYNU-201 | ENST00000264170 | 15316 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MEG8-223 | ENST00000638012 | 3757 nt | TSL 5 BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNH7-205 | ENST00000621889 | 1893 nt | TSL 5 BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRG4-201 | ENST00000370652 | 9820 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STARD4-201 | ENST00000296632 | 4606 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8D1-202 | ENST00000641015 | 8286 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL627171.1-201 | ENST00000618845 | 1308 nt | BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ST7-221 | ENST00000465133 | 2155 nt | TSL 5 BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA63.1-201 | ENST00000362493 | 131 nt | BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP119-201 | ENST00000362715 | 117 nt | BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP387-201 | ENST00000364226 | 106 nt | BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX35-202 | ENST00000367639 | 785 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.05 | □□□□□ -1.76 | | |