Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NEUROD1Q13562 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms