Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms