Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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