Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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IFT88Q13099 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
IFT88Q13099 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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