Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.3 ms