Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IRF9Q00978 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms