Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTPRMP28827 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTPRMP28827 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTPRMP28827 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTPRMP28827 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTPRMP28827 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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