Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPREP23469 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPREP23469 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms