Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKHD1P08F94 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms