Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms