Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NRF1Q16656 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms