Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF56Q15929 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms