Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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VPS72Q15906 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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