Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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