Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PDCD1Q15116 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PDCD1Q15116 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PDCD1Q15116 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PDCD1Q15116 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PDCD1Q15116 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PDCD1Q15116 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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