Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RFTN1Q14699 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms