Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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