Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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