Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
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