Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms