Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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