Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPRCP08575 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRCP08575 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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