Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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