Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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SH3BP4Q9P0V3 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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