Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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