Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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