Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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