Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CNGB1Q14028 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.8 ms